67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4911 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  63.86 
 
 
587 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4911  feruloyl esterase  100 
 
 
573 aa  1167    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591571  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5228  feruloyl esterase  92.51 
 
 
574 aa  1082    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172449  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5631  feruloyl esterase  92.51 
 
 
574 aa  1082    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4018  Feruloyl esterase  72.14 
 
 
577 aa  847    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000882838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  91.97 
 
 
573 aa  1091    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0831  chlorogenate esterase  75.35 
 
 
574 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2366  chlorogenate esterase  75.35 
 
 
563 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1073  tannase/feruloyl esterase family protein  75.35 
 
 
574 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1795  chlorogenate esterase  75.35 
 
 
574 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0634  chlorogenate esterase  75.35 
 
 
574 aa  854    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3219  tannase and feruloyl esterase  90.05 
 
 
572 aa  1013    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.084754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5459  feruloyl esterase  98.43 
 
 
573 aa  1152    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.827658  normal  0.315232 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  61.47 
 
 
597 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4598  feruloyl esterase  92.51 
 
 
574 aa  1083    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517638  hitchhiker  0.000228808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4538  tannase and feruloyl esterase  58.12 
 
 
569 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689604  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1156  feruloyl esterase  48.7 
 
 
578 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2927  tannase and feruloyl esterase  49.72 
 
 
579 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.146406  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3386  tannase and feruloyl esterase  47.42 
 
 
578 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.866711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  49.13 
 
 
576 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5301  putative feruloyl esterase  43.45 
 
 
559 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0117513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3196  putative feruloyl esterase  42.55 
 
 
554 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1909  hypothetical protein  41.36 
 
 
556 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0094  tannase and feruloyl esterase  40.94 
 
 
553 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  40.44 
 
 
564 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  37.48 
 
 
560 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1906  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.02 
 
 
514 aa  325  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18678  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1150  chlorogenate esterase  77.3 
 
 
251 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.873384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  32.32 
 
 
552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1290  putative tannase and feruloyl esterase  32.05 
 
 
575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1509  tannase and feruloyl esterase  31.12 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2863  feruloyl esterase  31.22 
 
 
579 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00992534  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  30.71 
 
 
571 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2982  hypothetical protein  30.14 
 
 
576 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.444016  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6036  feruloyl esterase  30.18 
 
 
606 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104543  normal  0.114417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7567  feruloyl esterase  30.67 
 
 
602 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00440654  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3537  tannase and feruloyl esterase  29.13 
 
 
553 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6149  Feruloyl esterase  33.96 
 
 
546 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6029  tannase and feruloyl esterase  30.76 
 
 
562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4357  tannase and feruloyl esterase  29.42 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6047  Feruloyl esterase  31.09 
 
 
556 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363794  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5786  tannase and feruloyl esterase  29.78 
 
 
562 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1752  Tannase and feruloyl esterase  30.04 
 
 
566 aa  167  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2279  feruloyl esterase  31.33 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2711  putative feruloyl esterase  28.8 
 
 
555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3251  tannase and feruloyl esterase  30.27 
 
 
565 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01772  feruloyl esterase, type B (Eurofung)  26.02 
 
 
527 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342481  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5946  tannase and feruloyl esterase  29.92 
 
 
572 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3044  feruloyl esterase  28.51 
 
 
476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4845  Tannase and feruloyl esterase  29.73 
 
 
552 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3841  tannase and feruloyl esterase (alpha/beta hydrolase family)  29.57 
 
 
604 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6529  feruloyl esterase  27.08 
 
 
615 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1301  feruloyl esterase  27.08 
 
 
615 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288361  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6136  feruloyl esterase  25.91 
 
 
615 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04040  feruloyl esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00960)  26.06 
 
 
523 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2302  Tannase and feruloyl esterase  24.41 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2115  putative chlorogenate esterase  34.62 
 
 
235 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3266  tannase and feruloyl esterase  25.82 
 
 
572 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7130  Tannase  26.41 
 
 
555 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000264682  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1578  tannase and feruloyl esterase  28.54 
 
 
566 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0081  Tannase and feruloyl esterase  26.03 
 
 
636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369493  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6287  Tannase and feruloyl esterase  27.34 
 
 
609 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000676989  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07213  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 
559 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02697  conserved hypothetical protein  23.46 
 
 
584 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00153901  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09203  tannase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03470)  21.97 
 
 
593 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02153  hypothetical protein  61.29 
 
 
58 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0239  hypothetical protein  28.92 
 
 
411 aa  44.3  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.780841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>