17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02153 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02153  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  56.76 
 
 		 587 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5228  feruloyl esterase  64.52 
 
 		 574 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172449  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5631  feruloyl esterase  64.52 
 
 		 574 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5459  feruloyl esterase  61.29 
 
 		 573 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.827658  normal  0.315232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4911  feruloyl esterase  61.29 
 
 		 573 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  61.29 
 
 		 573 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3219  tannase and feruloyl esterase  61.29 
 
 		 572 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.084754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4598  feruloyl esterase  64.52 
 
 		 574 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517638  hitchhiker  0.000228808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1290  putative tannase and feruloyl esterase  60 
 
 		 575 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4018  Feruloyl esterase  62.5 
 
 		 577 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000882838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2279  feruloyl esterase  47.62 
 
 		 556 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3537  tannase and feruloyl esterase  48.78 
 
 		 553 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3251  tannase and feruloyl esterase  60 
 
 		 565 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  51.61 
 
 		 571 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1509  tannase and feruloyl esterase  53.33 
 
 		 581 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6047  Feruloyl esterase  45.24 
 
 		 556 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363794  normal  0.322445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>