67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6029 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5786  tannase and feruloyl esterase  97.69 
 
 
562 aa  1073    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6029  tannase and feruloyl esterase  100 
 
 
562 aa  1136    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5946  tannase and feruloyl esterase  60.96 
 
 
572 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3537  tannase and feruloyl esterase  46.76 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1290  putative tannase and feruloyl esterase  44.41 
 
 
575 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1509  tannase and feruloyl esterase  45.59 
 
 
581 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4845  Tannase and feruloyl esterase  44.42 
 
 
552 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4357  tannase and feruloyl esterase  41.21 
 
 
570 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3251  tannase and feruloyl esterase  40.07 
 
 
565 aa  352  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  38.02 
 
 
571 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2279  feruloyl esterase  36.82 
 
 
556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6047  Feruloyl esterase  37.38 
 
 
556 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363794  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1752  Tannase and feruloyl esterase  39.29 
 
 
566 aa  322  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2711  putative feruloyl esterase  37.45 
 
 
555 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3266  tannase and feruloyl esterase  34.57 
 
 
572 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6149  Feruloyl esterase  35.67 
 
 
546 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  32.37 
 
 
560 aa  217  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  33.5 
 
 
564 aa  217  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  31.28 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  32.62 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5459  feruloyl esterase  31.52 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.827658  normal  0.315232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5631  feruloyl esterase  32.13 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.967793  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5228  feruloyl esterase  32.13 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172449  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6036  feruloyl esterase  31.92 
 
 
606 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104543  normal  0.114417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4911  feruloyl esterase  31.41 
 
 
573 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591571  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4598  feruloyl esterase  31.96 
 
 
574 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517638  hitchhiker  0.000228808 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7567  feruloyl esterase  31.43 
 
 
602 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00440654  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4538  tannase and feruloyl esterase  30.14 
 
 
569 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689604  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4018  Feruloyl esterase  30.14 
 
 
577 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000882838  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1578  tannase and feruloyl esterase  30.77 
 
 
566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5301  putative feruloyl esterase  28.25 
 
 
559 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0117513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3219  tannase and feruloyl esterase  31.45 
 
 
572 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.084754 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0831  chlorogenate esterase  30.56 
 
 
574 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0634  chlorogenate esterase  30.56 
 
 
574 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1795  chlorogenate esterase  30.56 
 
 
574 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1073  tannase/feruloyl esterase family protein  30.56 
 
 
574 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0094  tannase and feruloyl esterase  27.73 
 
 
553 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  30.3 
 
 
587 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2366  chlorogenate esterase  31.03 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421643  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  30.12 
 
 
597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1906  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.7 
 
 
514 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2863  feruloyl esterase  29.78 
 
 
579 aa  164  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00992534  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3044  feruloyl esterase  30.22 
 
 
476 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3386  tannase and feruloyl esterase  28.07 
 
 
578 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.866711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3196  putative feruloyl esterase  29.61 
 
 
554 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6287  Tannase and feruloyl esterase  32.89 
 
 
609 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000676989  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3841  tannase and feruloyl esterase (alpha/beta hydrolase family)  29.74 
 
 
604 aa  156  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1156  feruloyl esterase  28.09 
 
 
578 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2927  tannase and feruloyl esterase  27.48 
 
 
579 aa  156  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.146406  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2982  hypothetical protein  28.15 
 
 
576 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.444016  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01772  feruloyl esterase, type B (Eurofung)  28.43 
 
 
527 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342481  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1909  hypothetical protein  29 
 
 
556 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2302  Tannase and feruloyl esterase  28.12 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0081  Tannase and feruloyl esterase  29.37 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  27.05 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7130  Tannase  29.86 
 
 
555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000264682  normal  0.294319 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04040  feruloyl esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00960)  25.99 
 
 
523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6136  feruloyl esterase  29.18 
 
 
615 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6529  feruloyl esterase  28.21 
 
 
615 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1301  feruloyl esterase  28.21 
 
 
615 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288361  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09203  tannase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03470)  24.56 
 
 
593 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2115  putative chlorogenate esterase  39.13 
 
 
235 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07213  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
559 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1150  chlorogenate esterase  40.88 
 
 
251 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.873384  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02697  conserved hypothetical protein  31.85 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00153901  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09264  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 
202 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0956952  normal  0.404079 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07394  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 
329 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.164986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>