30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2345 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2345  LigA  100 
 
 		 490 aa  987    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  59.14 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8517  hypothetical protein  61.78 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236902  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0239  hypothetical protein  37.68 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.780841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  31.16 
 
 		 560 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  33.86 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  30.95 
 
 		 576 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  28.46 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3196  putative feruloyl esterase  33.54 
 
 		 554 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1795  chlorogenate esterase  30.53 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0831  chlorogenate esterase  30.53 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0634  chlorogenate esterase  30.53 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4538  tannase and feruloyl esterase  27.66 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1073  tannase/feruloyl esterase family protein  30.53 
 
 		 574 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5301  putative feruloyl esterase  32.24 
 
 		 559 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2366  chlorogenate esterase  30.53 
 
 		 563 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3044  feruloyl esterase  29.13 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0953377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  29.84 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4911  feruloyl esterase  28.57 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0055  feruloyl esterase  26.75 
 
 		 573 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.980773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  25.93 
 
 		 571 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  29.6 
 
 		 597 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.26 
 
 		 626 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1909  hypothetical protein  30.5 
 
 		 556 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1558  hypothetical protein  24.5 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.26 
 
 		 626 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5459  feruloyl esterase  27.78 
 
 		 573 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.827658  normal  0.315232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1156  feruloyl esterase  28.35 
 
 		 578 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2060  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  28.97 
 
 		 726 aa  43.5  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2927  tannase and feruloyl esterase  28 
 
 		 579 aa  43.5  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.146406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>