14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1558 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  834    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1419  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1144  hypothetical protein  25.88 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.548609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2985  hypothetical protein  26.82 
 
 		 501 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1940  hypothetical protein  25.99 
 
 		 467 aa  86.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0682  hypothetical protein  24.79 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1894  hypothetical protein  26.7 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.557849  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1329  hypothetical protein  24.4 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.295723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1128  hypothetical protein  24.66 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.541844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2024  hypothetical protein  23.83 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534725  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5148  hypothetical protein  36.04 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1116  hypothetical protein  28.85 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4898  hypothetical protein  28.46 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2345  LigA  24.5 
 
 		 490 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>