18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8517 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8517  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236902  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31720  hypothetical protein  61.54 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2345  LigA  61.78 
 
 		 490 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0239  hypothetical protein  34.76 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.780841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3533  feruloyl esterase  29.09 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4280  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  31.62 
 
 		 729 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3696  feruloyl esterase  28.99 
 
 		 576 aa  53.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0593  feruloyl esterase  36.11 
 
 		 552 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0245  Tannase and feruloyl esterase  32.82 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3987  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  31.43 
 
 		 718 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0395504  normal  0.53474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0128  feruloyl esterase  31.9 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5482  Tannase and feruloyl esterase  30.99 
 
 		 597 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6047  Feruloyl esterase  37.5 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363794  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2060  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  28.74 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173492  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5886  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  30.43 
 
 		 708 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3022  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  30.48 
 
 		 704 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0965207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4873  feruloyl esterase  29.84 
 
 		 587 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3386  tannase and feruloyl esterase  30.16 
 
 		 578 aa  43.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.866711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>