35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4280 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4280  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 729 aa  1477    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3022  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  51.02 
 
 		 704 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0965207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3987  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  50.88 
 
 		 718 aa  602  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0395504  normal  0.53474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3005  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  52.75 
 
 		 750 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120032  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3542  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  46.84 
 
 		 688 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.078354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2556  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  49.85 
 
 		 734 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2060  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  48.85 
 
 		 726 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173492  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1981  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  48.47 
 
 		 707 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4732  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  48.95 
 
 		 706 aa  581  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0083  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  46.3 
 
 		 700 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2544  hypothetical protein  46.5 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737003  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0749  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.5 
 
 		 682 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2223  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate- oligomer hydrolase  47.2 
 
 		 707 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0731014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1270  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  48.41 
 
 		 725 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3200  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  46.57 
 
 		 699 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3147  putative lipoprotein  46.57 
 
 		 699 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3932  hypothetical protein  45.59 
 
 		 696 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2028  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  46.57 
 
 		 699 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706846  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3184  alpha/beta fold family hydrolase  46.43 
 
 		 699 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1209  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.97 
 
 		 725 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.104805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0736  hypothetical protein  47.5 
 
 		 695 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173943 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2720  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  46.43 
 
 		 699 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1890  putative lipoprotein  46.43 
 
 		 699 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0886  hypothetical protein  46.43 
 
 		 699 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0719  hypothetical protein  47.21 
 
 		 695 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642996  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5988  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  47.09 
 
 		 707 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.470652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1960  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.47 
 
 		 722 aa  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0700058  normal  0.240709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0812  hypothetical protein  46.34 
 
 		 696 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0840  hypothetical protein  46.29 
 
 		 696 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0357  hypothetical protein  46.29 
 
 		 696 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.915085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1420  D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  46.36 
 
 		 698 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5886  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate-oligomer hydrolase  45.77 
 
 		 708 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1334  D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  47.74 
 
 		 725 aa  512  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.486001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3290  putative D-(-)-3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase  35.85 
 
 		 678 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8517  hypothetical protein  31.62 
 
 		 463 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236902  normal  0.839717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>