More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2587 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2599  putative amino acid permease  99.36 
 
 		 468 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2708  putative amino acid transporter  99.79 
 
 		 468 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0671509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2587  putative amino acid transporter  100 
 
 		 468 aa  946    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2545  putative amino acid transporter  99.79 
 
 		 468 aa  945    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.925413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2499  putative amino acid transporter  99.79 
 
 		 468 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.765594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  42.04 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  41.79 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  42.14 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  41.79 
 
 		 468 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 		 473 aa  316  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  42.68 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  36.91 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  41.49 
 
 		 478 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  37.26 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  39.35 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  42.18 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  42.18 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  38.94 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  38.94 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  41.94 
 
 		 474 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  41.01 
 
 		 513 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 		 473 aa  309  8e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  41.08 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  41.08 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  36.23 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  36.66 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  42.43 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  36.76 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  36.54 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  41.01 
 
 		 478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  36.23 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  36.54 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  36.76 
 
 		 473 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  41.69 
 
 		 474 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  37.95 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  37.95 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  37.95 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  36.01 
 
 		 473 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  37.73 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  40.89 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  39.33 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  42.31 
 
 		 527 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  40.69 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  39.57 
 
 		 470 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  37.92 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  39.07 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  36.85 
 
 		 467 aa  286  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  38.17 
 
 		 470 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  39.07 
 
 		 479 aa  282  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  37.76 
 
 		 490 aa  282  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  37.42 
 
 		 488 aa  280  5e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  35.02 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  36.03 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  35.96 
 
 		 526 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  35.96 
 
 		 526 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  36.38 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  36.38 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  36.38 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  36.38 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  37.12 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  36.38 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  36.38 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  36.38 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  37.59 
 
 		 496 aa  274  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1373  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  38.42 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  35.82 
 
 		 526 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  34.95 
 
 		 462 aa  272  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  36.44 
 
 		 489 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  36.41 
 
 		 511 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  35.92 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  35.71 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  36.64 
 
 		 511 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  38.26 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  36.53 
 
 		 493 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  37.55 
 
 		 488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  35.5 
 
 		 488 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  35.18 
 
 		 526 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  35.5 
 
 		 488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  39.07 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 514 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  35.73 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  36.43 
 
 		 511 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  35.52 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  35.52 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  35.76 
 
 		 490 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  35.29 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  36.43 
 
 		 536 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  37.15 
 
 		 489 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  37.62 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  37.62 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  37.62 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  37.47 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>