59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2112 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  59.43 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  62.77 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1843  hypothetical protein  65.17 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24244  normal  0.447273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2188  hypothetical protein  65.17 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1789  hypothetical protein  65.17 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  62 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  61.8 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  60.67 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  60.67 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  60.92 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  60.67 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  59.77 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  53.15 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  55.17 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  61.32 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  100  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  100  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  100  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  100  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.453342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  45.1 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2215  hypothetical protein  42.59 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1811  hypothetical protein  42.59 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  42.99 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  42.99 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  42.99 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  42.99 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  42.99 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1921  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  41.35 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  40.95 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  45.26 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  43.96 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  35.4 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  42.22 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  33.93 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  33.93 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  36.19 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  36.79 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1915  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1471  hypothetical protein  36.73 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  34.23 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  36 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4481  hypothetical protein  36.59 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  34.41 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  32.94 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  35.63 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  34.62 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  31.76 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1314  hypothetical protein  34.18 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1074  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1627  hypothetical protein  40.62 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  29.76 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>