57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3338 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  68.52 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  63.46 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  63.46 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1915  hypothetical protein  46.74 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  50.59 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  48.24 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  42.42 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  43.36 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  48.86 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  48.86 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1843  hypothetical protein  48.86 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24244  normal  0.447273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2188  hypothetical protein  48.86 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1789  hypothetical protein  48.86 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  40.57 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  36.84 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  36.84 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  47.73 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  46.59 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  46.59 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  46.59 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  38.94 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  36.54 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.453342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  36.94 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  36.94 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  35.19 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  41.12 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  37.04 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  43.18 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  36.45 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  37.84 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1921  hypothetical protein  37.07 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2215  hypothetical protein  36.94 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1811  hypothetical protein  36.94 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  45.88 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  41.38 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  34.29 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  33.91 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1471  hypothetical protein  35.09 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  40.48 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  31.48 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1627  hypothetical protein  33.7 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1314  hypothetical protein  34.02 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4481  hypothetical protein  32.5 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1074  hypothetical protein  36.11 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1190  hypothetical protein  27.5 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>