53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1373 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  77.14 
 
 		 117 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  70.8 
 
 		 115 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  78.16 
 
 		 117 aa  150  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  60.18 
 
 		 115 aa  140  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  55.45 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1471  hypothetical protein  47.57 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  40.22 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  39.45 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  39.45 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1915  hypothetical protein  36.56 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  34.41 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  37.25 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  38.68 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  38.68 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  39.33 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  38.14 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  38.89 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2188  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1843  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24244  normal  0.447273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1789  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  30.09 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  35.64 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  37.78 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  36 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  36.63 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  35.92 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.453342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  36.26 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  37.78 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  31.78 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  37.78 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  37.78 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  35.58 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  37.78 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1921  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2215  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1811  hypothetical protein  30.58 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  35.44 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  31.46 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  30.17 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  34.07 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  31.76 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>