48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1119 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  70.8 
 
 
115 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  68.18 
 
 
117 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  75.58 
 
 
117 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  56.52 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  54.55 
 
 
118 aa  128  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1471  hypothetical protein  45.19 
 
 
118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  35.19 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.453342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  36.89 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1915  hypothetical protein  38.1 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  35.92 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  35.65 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  34.26 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  35.65 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  34.23 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  39.39 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  33.94 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  33.94 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  33.94 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  33.94 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  37.5 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  37.5 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  34.21 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  34.04 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  32.65 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  31.53 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  32.95 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  32.38 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  30.68 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1843  hypothetical protein  32.22 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24244  normal  0.447273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  34.44 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2188  hypothetical protein  32.22 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711794  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1789  hypothetical protein  32.22 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  34.44 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  34.44 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  34.44 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  31.11 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.452703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  29.55 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  30.7 
 
 
123 aa  43.9  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  29.92 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  30.38 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>