57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1695 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  99.07 
 
 		 107 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  99.07 
 
 		 107 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  70.09 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  70.09 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  70.09 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  70.09 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  70.09 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  70.09 
 
 		 108 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  66.36 
 
 		 107 aa  151  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.453342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  64.49 
 
 		 107 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  65.42 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  56.07 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1811  hypothetical protein  60 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2215  hypothetical protein  60 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1921  hypothetical protein  60 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  42.99 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  43.43 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  40.91 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1789  hypothetical protein  41.11 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1843  hypothetical protein  41.11 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24244  normal  0.447273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2188  hypothetical protein  41.11 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  35.51 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  38.32 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  37.04 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  39.39 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  40.45 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  39.33 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  39.33 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  39.33 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1915  hypothetical protein  44.05 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  38.89 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  40.62 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  38.82 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  38.54 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  36.79 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  41.35 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  38.39 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  38.68 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  39.08 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  30.84 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1314  hypothetical protein  37.97 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1471  hypothetical protein  31.13 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  31.65 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4481  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1074  hypothetical protein  34.67 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1627  hypothetical protein  36.9 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  29.03 
 
 		 140 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>