35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1627 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1627  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  34.12 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  35.96 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  35.56 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  38.03 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  40.62 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  31.82 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  34.44 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.453342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1811  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1921  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2215  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  33.75 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  37.97 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  40.85 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  33.82 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  33.82 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  33.82 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  36.05 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  36.05 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  36.9 
 
 		 107 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  36.9 
 
 		 107 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  36.9 
 
 		 107 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1074  hypothetical protein  41.38 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  32.61 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1314  hypothetical protein  36.49 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>