57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2429 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  98.2 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  98.2 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  98.2 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  84.48 
 
 
121 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1789  hypothetical protein  88.89 
 
 
116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1843  hypothetical protein  88.89 
 
 
116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24244  normal  0.447273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2188  hypothetical protein  88.89 
 
 
116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711794  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  86.67 
 
 
116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  61.17 
 
 
105 aa  141  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  60.38 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  55.66 
 
 
106 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  59.43 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  59.43 
 
 
106 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  62.26 
 
 
106 aa  103  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.452703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  46.73 
 
 
117 aa  100  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  44.14 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  43.69 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  42.16 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  42.16 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  42.16 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  42.16 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  42.16 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  39.13 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  37.14 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.453342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  42.86 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  44.04 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  38.68 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1811  hypothetical protein  37.96 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2215  hypothetical protein  37.96 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1921  hypothetical protein  37.96 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  41.96 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  41.96 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  44.09 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  46.07 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  34.29 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  36.61 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  36.45 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1915  hypothetical protein  39.78 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1471  hypothetical protein  35.71 
 
 
118 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  37.11 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  33.96 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  39.08 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1314  hypothetical protein  37.23 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1074  hypothetical protein  37.33 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1627  hypothetical protein  33.75 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  32.05 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  25.2 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4481  hypothetical protein  31.71 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>