56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2062 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1843  hypothetical protein  89.66 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24244  normal  0.447273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2188  hypothetical protein  89.66 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1789  hypothetical protein  89.66 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  76.86 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  87.64 
 
 		 111 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2547  hypothetical protein  86.52 
 
 		 111 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127295  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2436  hypothetical protein  86.52 
 
 		 111 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1922  hypothetical protein  86.52 
 
 		 111 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289182  normal  0.0889344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  59.22 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  61.32 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  63.64 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  61.36 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  58.51 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  65.09 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2005  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  42.72 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  40.87 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1768  hypothetical protein  40.2 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.453342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1761  hypothetical protein  39.22 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1824  hypothetical protein  39.22 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1764  YdbL  39.22 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0536887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1512  YdbL  39.22 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1695  hypothetical protein  39.22 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  47.17 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35290  hypothetical protein  42.99 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2215  hypothetical protein  37.96 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1811  hypothetical protein  37.96 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1921  hypothetical protein  37.96 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  43.12 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3338  hypothetical protein  45.16 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0658151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  40.87 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1945  hypothetical protein  37.74 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0326345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1915  hypothetical protein  45.24 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  38.83 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1471  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  36.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  40.23 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  32.14 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  29.91 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4481  hypothetical protein  35.37 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1074  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1314  hypothetical protein  34.04 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  32.05 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  27.38 
 
 		 123 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>