10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1190 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1190  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  35.51 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  29.89 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  34.26 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1479  hypothetical protein  29.07 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  29.13 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  28.74 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  31.4 
 
 		 110 aa  42  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  28.74 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>