19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4040 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  46.03 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  44.17 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  34.86 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  39.24 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  29.76 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  29.76 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  26.32 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  29.7 
 
 		 211 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  25 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  25 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  25 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  25 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  25 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>