17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3130 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  71.95 
 
 		 219 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  60.18 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  58.59 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  54.98 
 
 		 226 aa  224  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  57.92 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  27.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  35.51 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  27.48 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  27.5 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  34.86 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  24.23 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  24.11 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  32.52 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  32.71 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  27.88 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>