17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0271 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  58.82 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  55.86 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  43.17 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  41.95 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  26.87 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  27.67 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  37.96 
 
 		 125 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  27.19 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  29.84 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  31.48 
 
 		 123 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  28.7 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  24.77 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>