66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0077 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0077  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4264  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  68 
 
 		 226 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0085  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  68 
 
 		 226 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0091  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  68 
 
 		 226 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0089  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  68.44 
 
 		 226 aa  318  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0088  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  67.56 
 
 		 226 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0069  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  67.11 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0085  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  68.44 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0090  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  68.44 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  67.11 
 
 		 226 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3966  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  69.06 
 
 		 226 aa  309  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0074  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  66.52 
 
 		 226 aa  309  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4180  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  64 
 
 		 226 aa  297  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4454  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  64.13 
 
 		 225 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3771  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  62.95 
 
 		 225 aa  295  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.166559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4855  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  63.23 
 
 		 225 aa  290  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1726  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  47.32 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1142  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  45.5 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1857  HAD family 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  45.54 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326852  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23800  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  43.3 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2047  HAD-superfamily hydrolase  45.09 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0245  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  44.25 
 
 		 230 aa  203  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0919  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  43.05 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3456  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  42.6 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0943  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  41.26 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0886  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  43.05 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3320  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  43.12 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3330  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  43.12 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3587  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  42.99 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3181  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  42.66 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0797  HAD superfamily hydrolase  42.79 
 
 		 227 aa  191  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0437994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42720  enolase-phosphatase  42.53 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3302  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  41.7 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1854  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  40.18 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0977225  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2625  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  41.59 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1780  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  37.07 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.269926  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00846  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  39.17 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06081  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  39.17 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0909  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  41.18 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1512  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  35.71 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.317976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1412  enolase-phosphatase  37.85 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.185542  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1345  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  37.85 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1994  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  42.52 
 
 		 238 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1413  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  35.92 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21781  putative enolase-phosphatase E-1  33.19 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0917092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1846  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  32.42 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31147  predicted protein  39.13 
 
 		 559 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0700452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2512  putative hydrolase  35.24 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0019  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  35 
 
 		 232 aa  134  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2913  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  31.88 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0985  2,3-diketo-5-methylthio-1- phosphopentanephosphat ase  33.17 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0489  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  30.67 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226131  normal  0.360579 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44113  predicted protein  31.65 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1789  enolase-phosphatase  25.25 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.022514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2439  enolase-phosphatase-like  31.11 
 
 		 112 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  27.05 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.52 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  25.2 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.79 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.15 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.03 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38 
 
 		 213 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  22.27 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>