More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0483 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 938 aa  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 938 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 938 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 924 aa  754    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 923 aa  758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 943 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 916 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 939 aa  735    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 946 aa  689    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 921 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 953 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1204  isoleucyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 		 917 aa  1156    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 936 aa  677    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 908 aa  709    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 940 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 943 aa  675    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 921 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 921 aa  688    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 913 aa  718    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 921 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 917 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1080  isoleucyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 917 aa  1164    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 931 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 931 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 951 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 943 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 941 aa  668    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 932 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 931 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 974 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 939 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 929 aa  701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 940 aa  712    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 978 aa  653    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 947 aa  678    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 948 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 940 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 943 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 924 aa  768    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 927 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0906  isoleucyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 921 aa  1196    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 973 aa  651    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 974 aa  651    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 923 aa  751    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 934 aa  692    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 943 aa  703    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 921 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 		 919 aa  1231    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 949 aa  704    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 954 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 943 aa  707    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 959 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 960 aa  644    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 930 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 945 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 946 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 943 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 968 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 940 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00980  isoleucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 942 aa  702    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 921 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 932 aa  695    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 940 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 934 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 917 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 945 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 943 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 944 aa  697    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 943 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 946 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0662  isoleucyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 		 917 aa  1163    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.756036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 947 aa  666    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 959 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 938 aa  665    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 936 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 940 aa  729    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 931 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 938 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 942 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 941 aa  726    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 937 aa  677    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 1152 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 940 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 940 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 941 aa  734    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 943 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 927 aa  684    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 946 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 919 aa  1250    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 943 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 943 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 940 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 940 aa  691    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 953 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 919 aa  699    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 965 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 987 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 928 aa  724    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 954 aa  707    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 940 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>