More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0780 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 938 aa  667    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 938 aa  707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 938 aa  705    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 924 aa  713    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 923 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 943 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 916 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 939 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 938 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 921 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 953 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1204  isoleucyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 917 aa  1084    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 936 aa  667    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 940 aa  737    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 940 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 943 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 921 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 921 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 951 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 921 aa  693    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 943 aa  698    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 940 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 931 aa  691    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 931 aa  684    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 943 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 941 aa  675    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 932 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0662  isoleucyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 917 aa  1095    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.756036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 940 aa  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 939 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 929 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 940 aa  727    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00980  isoleucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 942 aa  696    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 940 aa  724    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0508  isoleucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 936 aa  667    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 940 aa  706    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 943 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 913 aa  711    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 927 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 924 aa  740    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 973 aa  655    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 974 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 923 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 934 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 943 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 921 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 919 aa  1905    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 948 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 919 aa  702    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 943 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 917 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 965 aa  647    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 930 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 919 aa  719    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 946 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1080  isoleucyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 917 aa  1092    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 968 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 940 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 943 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 975 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 932 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 929 aa  720    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 934 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 938 aa  705    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 945 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 943 aa  700    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 987 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 931 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 946 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 949 aa  695    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 947 aa  680    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 938 aa  705    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 938 aa  650    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 940 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 940 aa  666    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 908 aa  714    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 943 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 942 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 941 aa  723    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 937 aa  665    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0906  isoleucyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 921 aa  1130    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 940 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 940 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 941 aa  714    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 943 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 927 aa  691    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 931 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 921 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 943 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 919 aa  1149    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0698  isoleucyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 938 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105082  normal  0.0586161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1156  isoleucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 940 aa  727    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102476  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 917 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 947 aa  689    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 946 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 944 aa  699    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 928 aa  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 954 aa  702    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 940 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0610  isoleucyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 916 aa  1139    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000217018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>