More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0977 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
938 aa  693    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
938 aa  720    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
938 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
924 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
923 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
943 aa  697    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
960 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
939 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2458  isoleucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
960 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
921 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
953 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1204  isoleucyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 
917 aa  1261    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
943 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
945 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
940 aa  715    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
943 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
921 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
921 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
941 aa  721    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
921 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
945 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
945 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
931 aa  641    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
931 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
944 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
943 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
941 aa  692    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
932 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
945 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
974 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
940 aa  725    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
929 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0971  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
945 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.581767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
978 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
945 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
951 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
940 aa  690    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
943 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
940 aa  718    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
927 aa  723    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
945 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
917 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
943 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
923 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
934 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
943 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
921 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
919 aa  1149    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
953 aa  672    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
954 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
943 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
959 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
946 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
930 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
945 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
946 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1080  isoleucyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 
917 aa  1275    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
943 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
939 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
931 aa  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
975 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
932 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
940 aa  706    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
934 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
921 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
945 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
943 aa  702    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
940 aa  718    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2112  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
945 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
946 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
931 aa  698    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
947 aa  694    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
959 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 
938 aa  662    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
936 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
948 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
946 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
945 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
942 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
940 aa  730    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
937 aa  713    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
1152 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
940 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
940 aa  707    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
941 aa  703    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
943 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
927 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
940 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
945 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
943 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
908 aa  672    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
917 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
924 aa  729    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
919 aa  695    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
949 aa  703    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
945 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
944 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
928 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
954 aa  709    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
940 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>