More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0906 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
938 aa  702    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
938 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
938 aa  683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
924 aa  739    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
923 aa  738    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
943 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
916 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
939 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2458  isoleucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
960 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
921 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
953 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1204  isoleucyl-tRNA synthetase  65.36 
 
 
917 aa  1232    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
940 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1080  isoleucyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 
917 aa  1256    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
940 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
943 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
921 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
921 aa  675    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
945 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
921 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
945 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
919 aa  665    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
931 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
931 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
945 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
943 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
941 aa  675    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
932 aa  682    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
940 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
960 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
940 aa  695    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
929 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
943 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
978 aa  658    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
945 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
943 aa  690    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
940 aa  683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
943 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
946 aa  687    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
927 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
945 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
973 aa  646    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
940 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
923 aa  734    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
934 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
943 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
921 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 
919 aa  1130    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
917 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
954 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
943 aa  694    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
921 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
924 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
930 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
945 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
946 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2112  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
945 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
949 aa  689    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
939 aa  701    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
940 aa  711    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
917 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
932 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
941 aa  715    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
934 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
940 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
945 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
943 aa  689    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
987 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
931 aa  711    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
946 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0662  isoleucyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 
917 aa  1251    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.756036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
947 aa  680    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
947 aa  675    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
938 aa  647    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
936 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0971  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
945 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.581767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
945 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
945 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
942 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
953 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
937 aa  696    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
1152 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
940 aa  695    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
940 aa  695    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
941 aa  716    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
943 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
927 aa  691    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
948 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
945 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
943 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
932 aa  635    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
908 aa  675    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
977 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
943 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
931 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
945 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
944 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
928 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
954 aa  727    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
940 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>