174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0411 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0411  fosmidomycin resistance protein  100 
 
 		 165 aa  324  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  99.38 
 
 		 406 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  99.38 
 
 		 406 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  99.38 
 
 		 406 aa  317  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  99.38 
 
 		 406 aa  317  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  99.38 
 
 		 406 aa  317  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  99.38 
 
 		 406 aa  317  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  98.75 
 
 		 406 aa  315  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  98.75 
 
 		 406 aa  315  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  95 
 
 		 406 aa  270  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  95.6 
 
 		 406 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  95.6 
 
 		 406 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  95.6 
 
 		 406 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  95.6 
 
 		 406 aa  270  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  93.08 
 
 		 406 aa  263  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  70.73 
 
 		 418 aa  236  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  70.97 
 
 		 416 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  70.97 
 
 		 417 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  70.97 
 
 		 416 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  68.75 
 
 		 416 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  70.97 
 
 		 417 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  70.97 
 
 		 417 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  68.75 
 
 		 416 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  81.25 
 
 		 406 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  70.32 
 
 		 420 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  80.5 
 
 		 404 aa  228  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  80.5 
 
 		 404 aa  228  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3174  putative membrane efflux protein  80.5 
 
 		 259 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  68.75 
 
 		 410 aa  225  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  67.5 
 
 		 403 aa  223  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  68.29 
 
 		 403 aa  222  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  69.28 
 
 		 403 aa  221  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  68.07 
 
 		 403 aa  220  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  76.25 
 
 		 412 aa  218  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  68.12 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  76.1 
 
 		 419 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  75.62 
 
 		 420 aa  214  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  72.39 
 
 		 412 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  72.39 
 
 		 413 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  71.78 
 
 		 412 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  72.56 
 
 		 409 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  71.78 
 
 		 412 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  71.78 
 
 		 412 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  73.55 
 
 		 412 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  74.19 
 
 		 412 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  74.38 
 
 		 419 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  59.75 
 
 		 412 aa  205  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  61.64 
 
 		 415 aa  205  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  65.81 
 
 		 403 aa  204  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  65.81 
 
 		 403 aa  204  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  70.44 
 
 		 410 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  61.39 
 
 		 408 aa  198  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  70.44 
 
 		 410 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  68.55 
 
 		 397 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  60.65 
 
 		 413 aa  194  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  59.75 
 
 		 410 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  59.75 
 
 		 410 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  60.65 
 
 		 401 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  69.38 
 
 		 423 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  69.38 
 
 		 404 aa  192  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  62.58 
 
 		 396 aa  191  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  66.04 
 
 		 403 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  60 
 
 		 421 aa  190  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  66.04 
 
 		 404 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 405 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  69.38 
 
 		 408 aa  188  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  57.42 
 
 		 421 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  65.41 
 
 		 404 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2162  major facilitator superfamily MFS_1  70.97 
 
 		 411 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  65.41 
 
 		 404 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  66.88 
 
 		 402 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  70.44 
 
 		 411 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  69.23 
 
 		 399 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  65.61 
 
 		 402 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1043  major facilitator transporter  68.15 
 
 		 415 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  66.45 
 
 		 398 aa  180  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  59.75 
 
 		 420 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  59.38 
 
 		 422 aa  180  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1170  major facilitator superfamily MFS_1  67.52 
 
 		 415 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.147511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  58.75 
 
 		 408 aa  176  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  62.5 
 
 		 415 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0973  major facilitator superfamily MFS_1  67.52 
 
 		 435 aa  174  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  64.78 
 
 		 420 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  59.12 
 
 		 431 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  65.58 
 
 		 400 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  65.16 
 
 		 400 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  57.5 
 
 		 403 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  60.13 
 
 		 403 aa  169  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  64.56 
 
 		 391 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  62.11 
 
 		 422 aa  168  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  63.23 
 
 		 421 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  62.58 
 
 		 421 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  49.68 
 
 		 402 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  49.68 
 
 		 403 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  49.68 
 
 		 403 aa  142  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  49.68 
 
 		 403 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  49.04 
 
 		 403 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  49.04 
 
 		 403 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 402 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  49.04 
 
 		 403 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>