100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4720 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4720  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4285  hypothetical protein  80.92 
 
 
338 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.70428  normal  0.412427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3428  hypothetical protein  52.63 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4493  protein of unknown function DUF185  52.03 
 
 
329 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9162  hypothetical protein  51.8 
 
 
321 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0094  hypothetical protein  48.48 
 
 
311 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8414  protein of unknown function DUF185  49.4 
 
 
345 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0322  protein of unknown function DUF185  44.64 
 
 
305 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  26.01 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.6 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  28 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  24.3 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  24.38 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  27.4 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  29 
 
 
386 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  27.33 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  29.13 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  26.87 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  27.07 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  26.59 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  25.27 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  25.63 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  24.78 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  29.13 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  27.02 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  29.44 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  26.32 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  20.77 
 
 
384 aa  62.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  21.17 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  27.53 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  24.38 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  25.8 
 
 
395 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  30.43 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  28.42 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  29.24 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  27.86 
 
 
386 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  22.31 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  21.36 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  24.26 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  26.94 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  25.87 
 
 
397 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  23.71 
 
 
386 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  30.07 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  28.03 
 
 
396 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  28.09 
 
 
358 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  22.93 
 
 
370 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  27.02 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  21.26 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  26.16 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  20.53 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  28.16 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  21.83 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  27.8 
 
 
375 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  27.73 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  26.24 
 
 
384 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  26.82 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  26.84 
 
 
397 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  28.61 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  25.4 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  28.61 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  25.47 
 
 
400 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  27.56 
 
 
353 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  27.68 
 
 
358 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  26.67 
 
 
400 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  27.96 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  27.68 
 
 
368 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  21.18 
 
 
370 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  26.54 
 
 
366 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  27.64 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  22.47 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  28.25 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  23.39 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  21.88 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  23.1 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  26.16 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  25.66 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  24.56 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  27.11 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  26.16 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  26.2 
 
 
410 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  25.47 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  25.08 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  20 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  26.3 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0876  hypothetical protein  28.28 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  24.4 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  26.07 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  27.07 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  26.48 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  26.3 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  18.88 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  19.51 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  19.51 
 
 
370 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  19.51 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  20.9 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>