25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0239 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0239    100 
 
 		 239 bp  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000395397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  82.05 
 
 		 1389 bp  87.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  89.33 
 
 		 1482 bp  85.7  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  88.46 
 
 		 1374 bp  83.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  86.52 
 
 		 1395 bp  81.8  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  82.58 
 
 		 1440 bp  79.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  82.22 
 
 		 1374 bp  77.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  84.31 
 
 		 1326 bp  75.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  92.31 
 
 		 1491 bp  71.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  92.16 
 
 		 1398 bp  69.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  84.04 
 
 		 1386 bp  67.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  85.9 
 
 		 1674 bp  67.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  83.87 
 
 		 1353 bp  65.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  90.38 
 
 		 1383 bp  63.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  90.2 
 
 		 1086 bp  61.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  80.83 
 
 		 1365 bp  56  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  88.24 
 
 		 1380 bp  54  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  88.24 
 
 		 1308 bp  54  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  88.24 
 
 		 1308 bp  54  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  82.22 
 
 		 1341 bp  52  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  86.54 
 
 		 1389 bp  48.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  86.54 
 
 		 1434 bp  48.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  86.54 
 
 		 1422 bp  48.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  86.27 
 
 		 1389 bp  46.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  86.27 
 
 		 1395 bp  46.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>