36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2241 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  64.17 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  60.87 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  51.24 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  51.24 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  50.41 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  52.07 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  49.15 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  48.28 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  49.11 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  48.31 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  45.83 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  49.56 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  55.17 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  43.64 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  44.35 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  39.09 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  45.16 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  34.48 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  43.21 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  30 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  49.3 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  34.02 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  48.15 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  35.85 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  39.29 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  29.21 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  35.62 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  30.77 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  29.89 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  32.04 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  29.36 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  31.51 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3450  hypothetical protein  38.03 
 
 		 115 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>