34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0507 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  41.74 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  44.55 
 
 
118 aa  94.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  40.91 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  45.22 
 
 
117 aa  93.2  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  45.45 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  43.64 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  51.22 
 
 
139 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  41.51 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  42.34 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  41.23 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  38.6 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  45.95 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  37.84 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  44.83 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  39.09 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  41.05 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  38.98 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  41.23 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  38.68 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  36.84 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  45.88 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  40.51 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  36.04 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  43.48 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  47.83 
 
 
54 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3450  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  35.4 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  30.12 
 
 
98 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>