30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0627 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  47.41 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  49.12 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  52.04 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  48.62 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  44.64 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  46.73 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  45.54 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  43.48 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  50.59 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  44.64 
 
 		 113 aa  83.6  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  42.11 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  40.98 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  43.97 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  54.1 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  42.35 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  63.64 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  41.75 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  42.35 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  42.68 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  38.55 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  40.28 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  41.38 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  28.33 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  33.8 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  29.85 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>