16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2689 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  31.4 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  47.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  32.46 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  34.58 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  29.36 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3450  hypothetical protein  35.8 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  30.91 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  37.25 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  28.28 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  30.48 
 
 		 125 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  31.3 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  31.51 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  28.7 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>