37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1699 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  233  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  49.56 
 
 
116 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  49.11 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  52.25 
 
 
118 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  48.28 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  52.21 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  46.09 
 
 
125 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  48.65 
 
 
118 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  51.75 
 
 
120 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  47.37 
 
 
127 aa  103  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  46.61 
 
 
124 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  53.51 
 
 
123 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  45.22 
 
 
115 aa  93.2  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  41.23 
 
 
113 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  38.89 
 
 
125 aa  87.8  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  51.25 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  39.81 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  36.04 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  48.1 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  40.35 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  39.32 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  39.42 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  32.71 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  47.06 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  31.82 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  30.48 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  34.62 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  31.37 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  36.49 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  34.15 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  34.58 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  26.61 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  26.61 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  25.47 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  70.37 
 
 
54 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>