68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3761 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  100 
 
 		 127 aa  263  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  47.27 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  30.7 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0596  S23 ribosomal protein  26.67 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0419728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  31.91 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0925  S23 ribosomal protein  31.91 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  24.58 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  24.58 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  24.58 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  24.58 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  24.58 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  30.7 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  24.77 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  24.77 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0610  S23 ribosomal protein  28.83 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28865e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  24.77 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  30.91 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  30.7 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  27.52 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  31.76 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3816  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2891  hypothetical protein  27.97 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0159035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3825  hypothetical protein  32.97 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.169171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  34.12 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  31.37 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  28.74 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  30 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  26.13 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  26.13 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  26.13 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  26.13 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  30.7 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  28.7 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0033  hypothetical protein  26.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0769  hypothetical protein  24.07 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0716  hypothetical protein  24.07 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  22.52 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1160  S23 ribosomal protein  30.36 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  25.27 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  30.49 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  26.79 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  26.13 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  26.09 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0984  S23 ribosomal  32.79 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302642  normal  0.219777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2403  hypothetical protein  27.27 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.589367  hitchhiker  0.00347564 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  28.74 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  27.59 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03005  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2639  S23 ribosomal protein  25.66 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  31.73 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  31.17 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  25.86 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  26.79 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  25.44 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  30.84 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2269  S23 ribosomal protein  27.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  25.47 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  26.67 
 
 		 125 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  25.45 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1960  S23 ribosomal protein  25.44 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2609  S23 ribosomal protein  26.32 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.839204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  39.71 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  29.41 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  24.8 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1940  S23 ribosomal protein  24.56 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0249687  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1949  S23 ribosomal protein  24.56 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.512605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2996  hypothetical protein  28.93 
 
 		 118 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>