94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2569 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  100 
 
 
115 aa  234  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3825  hypothetical protein  61.82 
 
 
118 aa  155  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.169171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2891  hypothetical protein  56.36 
 
 
121 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0159035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  52.63 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  49.11 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3816  hypothetical protein  50.93 
 
 
123 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  52.73 
 
 
119 aa  117  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0925  S23 ribosomal protein  51.82 
 
 
118 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  45.95 
 
 
123 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  48.21 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  50.54 
 
 
121 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  40.71 
 
 
117 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  46.55 
 
 
119 aa  104  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  47.71 
 
 
119 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  53.41 
 
 
116 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0033  hypothetical protein  41.38 
 
 
116 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  41.74 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0716  hypothetical protein  48.24 
 
 
120 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0769  hypothetical protein  48.24 
 
 
120 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  40.37 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2639  S23 ribosomal protein  47.19 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  39.45 
 
 
119 aa  90.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3674  S23 ribosomal protein  36.21 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  49.43 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03005  hypothetical protein  51.16 
 
 
135 aa  87  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2403  hypothetical protein  44.55 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.589367  hitchhiker  0.00347564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4754  S23 ribosomal protein  47.56 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  40.35 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  43.68 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2018  S23 ribosomal protein  37.93 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.575414  normal  0.264087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  44.76 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  40.54 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  40.54 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  40.54 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  40.54 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  41.44 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  33.96 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  39.29 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0984  S23 ribosomal  44.71 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302642  normal  0.219777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  41.12 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  39.64 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  41.86 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  39.64 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  39.64 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  39.64 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  39.64 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  39.64 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  39.64 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  41.84 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1960  S23 ribosomal protein  40.95 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1652  hypothetical protein  40.22 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193408  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1949  S23 ribosomal protein  40 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.512605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1495  S23 ribosomal protein  38.53 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1940  S23 ribosomal protein  40 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0249687  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  40.95 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  41.11 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  38.94 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2263  hypothetical protein  46.34 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  decreased coverage  0.000429969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  35.71 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0809  S23 ribosomal protein  33.03 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3212  S23 ribosomal protein  37.84 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2609  S23 ribosomal protein  38.1 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.839204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1770  hypothetical protein  34.86 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00388506  normal  0.0836423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.6 
 
 
583 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3192  hypothetical protein  40.23 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3034  S23 ribosomal protein  35.29 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2542  hypothetical protein  39.08 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  37.61 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1383  hypothetical protein  39.08 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1864  S23 ribosomal protein  41.38 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.508556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2144  hypothetical protein  33.91 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1316  hypothetical protein  39.08 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0254819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2821  hypothetical protein  37.78 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4127  hypothetical protein  34.48 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0610  S23 ribosomal protein  34.12 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28865e-18 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2787  hypothetical protein  30.63 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000122053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0596  S23 ribosomal protein  35.71 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0419728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0863  S23 ribosomal protein  38.55 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2269  S23 ribosomal protein  32.73 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  41.18 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1160  S23 ribosomal protein  35.34 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  37.78 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0039  S23 ribosomal  36.54 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.746441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0782  S23 ribosomal protein  36.61 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0266  hypothetical protein  39.02 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3035  S23 ribosomal  37.04 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.964559  hitchhiker  0.00587494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  30.91 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3995  hypothetical protein  41.18 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  34.88 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1934  S23 ribosomal protein  40.26 
 
 
85 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285916  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  35.53 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0795  S23 ribosomal protein  29.82 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361615  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3459  S23 ribosomal protein  36.11 
 
 
127 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>