33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0342 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  94.07 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  71.43 
 
 		 120 aa  176  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  62.28 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  60.91 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  61.82 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  58.56 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  54.39 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  53.21 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  52.07 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  48.65 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  51.69 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  50.43 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  43.48 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  53.57 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  49.38 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  39.32 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  40.18 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  37.17 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  53.97 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  32.35 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  38.04 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  36.84 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  28.44 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  36.71 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  30.84 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  45.45 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  22.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>