32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0452 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  67.95 
 
 
90 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  61.63 
 
 
113 aa  103  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  57.32 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  54.88 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  52.44 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  49.41 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  52.56 
 
 
125 aa  84  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  47.56 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  44.58 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  44.71 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  54.1 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  50.77 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  37.35 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  34.83 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  42.31 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  39.19 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  41.18 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  46.51 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  39.74 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  39.13 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  38.37 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  32.94 
 
 
132 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  38.75 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  29.17 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  26.32 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  32.43 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  57.58 
 
 
54 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  35.14 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>