28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1034 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  186  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  58.97 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  62.03 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  72.88 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  58.75 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  53.09 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  48.89 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  49.38 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  49.38 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  53.16 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  48.1 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  52.05 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  63.64 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  43.21 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  40.51 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  39.24 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  39.24 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  49.15 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  40.51 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  33.77 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  41.98 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  37.68 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  37.8 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  34.12 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  30.56 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>