45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1388 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  228  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  62.28 
 
 
120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  60.91 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  62.28 
 
 
125 aa  143  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  60.91 
 
 
118 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  64.22 
 
 
125 aa  138  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  59.65 
 
 
127 aa  133  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  55.45 
 
 
116 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  49.56 
 
 
117 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  56.76 
 
 
113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  50.43 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  53.51 
 
 
123 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  49.56 
 
 
121 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  55.17 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  58.75 
 
 
90 aa  96.7  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  43.86 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  39.66 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  46.15 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  50.7 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  35.65 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  34.55 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  33.94 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  39.25 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  30.77 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  30.56 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  39.51 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  32.46 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  29.09 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  32.46 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  29.7 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  32.14 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  34.18 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  57.14 
 
 
54 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  32.67 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  35.37 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  35.37 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  35.37 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  35.37 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  36.23 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  26.47 
 
 
118 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  25.47 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  26.32 
 
 
123 aa  40  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>