33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0975 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  60 
 
 
125 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  60.34 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  59.65 
 
 
116 aa  133  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  54.39 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  54.39 
 
 
118 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  56.36 
 
 
125 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  54.13 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  56.52 
 
 
113 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  49.15 
 
 
121 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  53.98 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  47.37 
 
 
117 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  46.49 
 
 
123 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  58.73 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  48.1 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  39.09 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  34.21 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  35.34 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  37.11 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  41.28 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  30.36 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  36.75 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  34.67 
 
 
78 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  24.04 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  33.8 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  31 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  28.57 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  29.41 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>