28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2527 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  236  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  50.88 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  52.73 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  41.96 
 
 		 120 aa  95.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  42.2 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  38.53 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  34.55 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  39.09 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  37.17 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  41.23 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  32.38 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  33.9 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  39.24 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  37.68 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  26.36 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  32.32 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  33.01 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  36.9 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  47.92 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  32.71 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  25.23 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>