31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2918 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  49.57 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  41.18 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  41.96 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  37.89 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  41.28 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  39.42 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  36.61 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  39.6 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  45.88 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  35.96 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  48.15 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  35.4 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  40.95 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  40.45 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  36.97 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  39.13 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  43.66 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  30.56 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  38.04 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  41.25 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  32.41 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  42.47 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  37.68 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  42.03 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  31.3 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  36.25 
 
 		 127 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>