41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3673 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  49.11 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  48.31 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  44.83 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  43.22 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  43.48 
 
 		 118 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  43.44 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  43.12 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  46.23 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  41.96 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  43.86 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  53.75 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  41.51 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  44.92 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  36.52 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  33.91 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  30.63 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  32.32 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  40.51 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  29.36 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  40.85 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  29.46 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  36.46 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  31.37 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  29.63 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  31.07 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  30.91 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  52.5 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  26.79 
 
 		 127 aa  43.5  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  30.48 
 
 		 122 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  30.48 
 
 		 122 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  30.48 
 
 		 122 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  30.48 
 
 		 122 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  25.22 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  30.26 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>