42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1490 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  251  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  64.17 
 
 
121 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  55.65 
 
 
116 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  55.08 
 
 
120 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  54.7 
 
 
124 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  53.51 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  52.17 
 
 
125 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  53.51 
 
 
116 aa  116  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  51.69 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  51.33 
 
 
118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  46.49 
 
 
127 aa  106  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  44.92 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  45.95 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  43.7 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  49.44 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  50.59 
 
 
122 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  36.21 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  39.42 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  61.82 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  41.98 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  32.35 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  33.65 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  32.71 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  39.13 
 
 
98 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  35.14 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  25.47 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  32.5 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  32.38 
 
 
118 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  28.7 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  63.33 
 
 
54 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  36.25 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  32.05 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  32.04 
 
 
115 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  29.36 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  32.18 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  32.18 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  32.18 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  32.18 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  29.91 
 
 
123 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>