41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4775 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  239  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  71.43 
 
 
118 aa  176  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  71.43 
 
 
118 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  65.22 
 
 
125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  62.28 
 
 
116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  60.34 
 
 
127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  57.27 
 
 
125 aa  137  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  58.18 
 
 
116 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  54.87 
 
 
124 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  55.08 
 
 
123 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  50.41 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  50.88 
 
 
113 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  51.75 
 
 
117 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  40.91 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  56.82 
 
 
139 aa  94  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  53.09 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  39.47 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  36.75 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  32.77 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  45.65 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  50.7 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  32.11 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  35.78 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  32.11 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  30.21 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  35.53 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  36.26 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  32.43 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  32.43 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  32.43 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  32.43 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2487  S23 ribosomal protein  26.89 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  37.25 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  40 
 
 
54 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  28.24 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  26.21 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1160  S23 ribosomal protein  33.33 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  24.53 
 
 
128 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>