32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1893 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  243  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  40.35 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  38.98 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  37.61 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  33.9 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  39.25 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  30.63 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  36.89 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  34.23 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  35.09 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  34.29 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  32.48 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  35.29 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  39.42 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  33.64 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  33.64 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  33.64 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  32.11 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  36.36 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  32.38 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  40.28 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  32.71 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  35.14 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3450  hypothetical protein  32.11 
 
 
115 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  37.8 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  48.98 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  29.36 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  34.78 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  35.29 
 
 
118 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>