33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0322 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  94.07 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  71.43 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  61.4 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  60.91 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  59.46 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  58.18 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  54.39 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  51.24 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  53.21 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  52.25 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  51.33 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  49.15 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  44.55 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  41.96 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  54.76 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  49.38 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  39.47 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  38.53 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  41.11 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  49.21 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  32.35 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  41.25 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  34.12 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  34.21 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  37.97 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  31.73 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2743  hypothetical protein  23.81 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0712  hypothetical protein  47.73 
 
 		 54 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>