More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1005 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1005  Acetyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 386 aa  754    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  40.5 
 
 		 401 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  39.45 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000180504  hitchhiker  0.0045397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  40.25 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5067  acetyl-CoA acetyltransferase  40.75 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  39.25 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  41 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  39 
 
 		 401 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  41.21 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  41.21 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  38.25 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  40.7 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1534  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.12 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.0334478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2753  acetyl-CoA acetyltransferase  39 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  39.5 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  41.58 
 
 		 403 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  40.59 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0341  acetyl-CoA acetyltransferase  38.86 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7185  acetyl-CoA acetyltransferase  39.5 
 
 		 401 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3015  acetyl-CoA acetyltransferase  39.5 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554665  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  37.19 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  39.21 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1398  acetyl-CoA acetyltransferase  37.12 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1538  acetyl-CoA acetyltransferase  36.87 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.697645  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  38.81 
 
 		 403 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4458  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  38.35 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.955606  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  35.5 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5873  acetyl-CoA acetyltransferase  40.25 
 
 		 401 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  38.56 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4182  acetyl-CoA acetyltransferase  38.67 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0464  acetyl-CoA acetyltransferase  35.75 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  36.62 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0836  acetyl-CoA acetyltransferase  36.07 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5240  acetyl-CoA acetyltransferase  37.65 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  38.56 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4371  acetyl-CoA acetyltransferase  40.3 
 
 		 402 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0003  acetyl-CoA acetyltransferase  37.66 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3568  acetyl-CoA acetyltransferase  36.23 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.996401  normal  0.399886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2975  acetyl-CoA acetyltransferase  36.82 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00597793  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30250  acetyl-CoA acetyltransferase  37.75 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.674697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4563  acetyl-CoA acetyltransferases  38.9 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  38.97 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2870  acetyl-CoA acetyltransferase  36.32 
 
 		 403 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3279  acetyl-CoA acetyltransferase  36.63 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  38.17 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2943  acetyl-CoA acetyltransferase  38.81 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  37.86 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  34.65 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  37.59 
 
 		 500 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3244  acetyl-CoA acetyltransferase  36.88 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  38.16 
 
 		 410 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  37.62 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1561  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.332281  normal  0.704094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3440  acetyl-CoA acetyltransferase  35.66 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1771  acetyl-CoA acetyltransferase  38.86 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0090  acetyl-CoA acetyltransferase  36.99 
 
 		 414 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.945472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5262  acetyl-CoA acetyltransferase  37.86 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  36.59 
 
 		 401 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  36.59 
 
 		 401 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4830  acetyl-CoA acetyltransferase  37.14 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  35.16 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  37.03 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0072  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1823  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516733  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.28 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2729  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3619  acetyl-CoA acetyltransferase  37.83 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1657  acetyl-CoA acetyltransferase  36.09 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0286  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 617 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3891  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201357  normal  0.156596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0214  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 		 402 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0598  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  32.51 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  37.4 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0281  thiolase  34.66 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0145  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267922  normal  0.198223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0739  acetyl-CoA acetyltransferase  37.88 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  35.87 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  37.35 
 
 		 391 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0794  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0745  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4032  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4605  acetyl-CoA acetyltransferase  31.6 
 
 		 402 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0022  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.899492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0531  acetyl-CoA acetyltransferase  35.31 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0145948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0695  acetyl-CoA acetyltransferase  35.5 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  37.72 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  32.42 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2480  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 		 385 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1457  acetyl-CoA acetyltransferase  35.4 
 
 		 390 aa  185  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.749301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0805  acetyl-CoA acetyltransferase  31.44 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4388  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 		 384 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000185957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 		 397 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2617  acetyl-CoA acetyltransferases  34.26 
 
 		 394 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>