More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0281 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0281  thiolase  100 
 
 
402 aa  809    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
401 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
401 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 
401 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  65.58 
 
 
500 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3568  acetyl-CoA acetyltransferase  64.43 
 
 
402 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.996401  normal  0.399886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0072  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 
401 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2729  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
401 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0286  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 
617 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1823  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
401 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3244  acetyl-CoA acetyltransferase  63.68 
 
 
402 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  61.69 
 
 
401 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3440  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 
402 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  60.7 
 
 
402 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0003  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
402 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5240  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
402 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3279  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 
402 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4605  acetyl-CoA acetyltransferase  59.2 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0464  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
401 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  59.45 
 
 
402 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0214  acetyl-CoA acetyltransferase  59.7 
 
 
402 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0145  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
402 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267922  normal  0.198223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0886  acetyl-CoA acetyltransferase  61.19 
 
 
402 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679182  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0794  acetyl-CoA acetyltransferase  58.71 
 
 
402 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4032  acetyl-CoA acetyltransferase  58.46 
 
 
402 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126529  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0745  acetyl-CoA acetyltransferase  58.71 
 
 
402 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0598  acetyl-CoA acetyltransferase  57.71 
 
 
402 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0805  acetyl-CoA acetyltransferase  60.7 
 
 
402 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  60.7 
 
 
402 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0022  acetyl-CoA acetyltransferase  59.2 
 
 
402 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.899492  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  58.54 
 
 
402 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2753  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
401 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43749  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  59.31 
 
 
403 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  59.1 
 
 
402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  58.81 
 
 
403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7185  acetyl-CoA acetyltransferase  59.2 
 
 
401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1538  acetyl-CoA acetyltransferase  57.04 
 
 
402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.697645  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  57.46 
 
 
401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4563  acetyl-CoA acetyltransferases  58.6 
 
 
403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274398  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1398  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  58.56 
 
 
403 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3015  acetyl-CoA acetyltransferase  59.45 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554665  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5873  acetyl-CoA acetyltransferase  57.46 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1657  acetyl-CoA acetyltransferase  60.55 
 
 
401 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4458  acetyl-CoA acetyltransferase  59.45 
 
 
401 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  58.15 
 
 
403 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2870  acetyl-CoA acetyltransferase  57.07 
 
 
403 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  58.15 
 
 
403 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4182  acetyl-CoA acetyltransferase  57.57 
 
 
402 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2943  acetyl-CoA acetyltransferase  57.14 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  56.47 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  57.14 
 
 
403 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3891  acetyl-CoA acetyltransferase  61.69 
 
 
400 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201357  normal  0.156596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4371  acetyl-CoA acetyltransferase  58.31 
 
 
402 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0836  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.699301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  56.86 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2975  acetyl-CoA acetyltransferase  55.09 
 
 
403 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00597793  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  56.97 
 
 
401 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  56.64 
 
 
403 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  56.64 
 
 
403 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  56.14 
 
 
403 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5262  acetyl-CoA acetyltransferase  58.72 
 
 
407 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514343  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
401 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  56.14 
 
 
412 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  56.39 
 
 
403 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  55.39 
 
 
403 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0341  acetyl-CoA acetyltransferase  55.45 
 
 
403 aa  428  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  54.77 
 
 
402 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000180504  hitchhiker  0.0045397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  54.98 
 
 
405 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.955606  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5067  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 
403 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30250  acetyl-CoA acetyltransferase  56.89 
 
 
403 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.674697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.24 
 
 
402 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1561  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 
403 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.332281  normal  0.704094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  56.1 
 
 
409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  49.52 
 
 
417 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4830  acetyl-CoA acetyltransferase  48.8 
 
 
417 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  49.28 
 
 
417 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 
415 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1771  acetyl-CoA acetyltransferase  47.61 
 
 
417 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  47.03 
 
 
416 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0090  acetyl-CoA acetyltransferase  45.08 
 
 
414 aa  328  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.945472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3619  acetyl-CoA acetyltransferase  47.71 
 
 
412 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  46.9 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  42.47 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  44.86 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2345  acetyl-CoA acetyltransferase  42.19 
 
 
407 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3409  acetyl-CoA acetyltransferase  42.32 
 
 
401 aa  297  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3484  acetyl-CoA acetyltransferase  71.92 
 
 
210 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1534  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.11 
 
 
389 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.0334478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  43.84 
 
 
395 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.63 
 
 
397 aa  289  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  43.38 
 
 
397 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 
391 aa  287  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0453  acetyl-CoA acetyltransferase  43.14 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0775  acetyl-CoA acetyltransferase  44.63 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
379 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>