More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1771 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1771  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 417 aa  833    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4830  acetyl-CoA acetyltransferase  77.7 
 
 		 417 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  77.94 
 
 		 417 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3991  acetyl-CoA acetyltransferase  79.14 
 
 		 417 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  74.34 
 
 		 415 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  73.38 
 
 		 416 aa  625  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  72.9 
 
 		 415 aa  611  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3619  acetyl-CoA acetyltransferase  72.9 
 
 		 412 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0090  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498673  normal  0.945472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  70.26 
 
 		 410 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.80171  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2753  acetyl-CoA acetyltransferase  49.76 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2489  acetyl-CoA acetyltransferase  50.24 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5873  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2591  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7185  acetyl-CoA acetyltransferase  50.84 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2295  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 403 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  49.04 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4631  acetyl-CoA acetyltransferase  47.61 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0872  acetyl-CoA acetyltransferase  49.04 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0901574  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4458  acetyl-CoA acetyltransferase  49.52 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3015  acetyl-CoA acetyltransferase  48.8 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554665  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42090  acetyl-CoA acetyltransferase  48.8 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6110  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2197  acetyl-CoA acetyltransferase  48.2 
 
 		 402 aa  359  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000180504  hitchhiker  0.0045397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3569  acetyl-CoA acetyltransferase  48.8 
 
 		 401 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5668  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 400 aa  358  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3851  acetyl-CoA acetyltransferase  47.74 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4928  acetyl-CoA acetyltransferase  47.74 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.5477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4504  acetyl-CoA acetyltransferase  46.76 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  47.48 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0542  acetyl-CoA acetyltransferases  47.13 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0376899  normal  0.0679455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1561  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.332281  normal  0.704094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1186  acetyl-CoA acetyltransferase  45.89 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3279  acetyl-CoA acetyltransferase  48.8 
 
 		 402 aa  348  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3568  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.996401  normal  0.399886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0341  acetyl-CoA acetyltransferase  47.02 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4605  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 		 402 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2870  acetyl-CoA acetyltransferase  47.61 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0805  acetyl-CoA acetyltransferase  46.9 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0061  acetyl-CoA acetyltransferase  47.28 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1398  acetyl-CoA acetyltransferase  45.78 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4182  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1470  acetyl-CoA acetyltransferase  47.13 
 
 		 404 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0836  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5240  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1538  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.697645  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3244  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3440  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0886  acetyl-CoA acetyltransferase  46.89 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2975  acetyl-CoA acetyltransferase  45.22 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00597793  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0736  acetyl-CoA acetyltransferase  45.93 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  44.68 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0281  thiolase  47.61 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3891  acetyl-CoA acetyltransferase  49.04 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201357  normal  0.156596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10876  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 412 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0134606  normal  0.123621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0003  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 		 402 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4371  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0794  acetyl-CoA acetyltransferase  43.97 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0464  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5510  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.93 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0214  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0745  acetyl-CoA acetyltransferase  43.97 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4563  acetyl-CoA acetyltransferases  45.8 
 
 		 403 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4032  acetyl-CoA acetyltransferase  43.97 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2943  acetyl-CoA acetyltransferase  46.88 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0145  acetyl-CoA acetyltransferase  44.92 
 
 		 402 aa  329  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267922  normal  0.198223 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0072  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 		 401 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1823  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2729  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0286  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 		 617 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0022  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.899492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1657  acetyl-CoA acetyltransferase  45.19 
 
 		 401 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0916  acetyl-CoA acetyltransferases  46.67 
 
 		 403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  43.06 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1517  acetyl-CoA acetyltransferase  46.3 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4493  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1540  acetyl-CoA acetyltransferase  46.3 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4580  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0242  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0598  acetyl-CoA acetyltransferase  43.74 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1691  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 403 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5067  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 403 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4876  acetyl-CoA acetyltransferase  45.08 
 
 		 403 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.038952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  45 
 
 		 405 aa  319  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.955606  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30250  acetyl-CoA acetyltransferase  46.3 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.674697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2110  acetyl-CoA acetyltransferase  44.84 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3758  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942473  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7118  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.11 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2997  Acetyl-CoA C-acyltransferase  43.63 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5262  acetyl-CoA acetyltransferase  45.05 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2000  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1230  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00138705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0085  acetyl-CoA acetyltransferase  43.75 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1960  acetyl-CoA acetyltransferase  43.16 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.201942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2359  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 		 383 aa  286  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0302986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0842  acetyl-CoA acetyltransferase  43.87 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.404151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4162  acetyl-CoA acetyltransferase  43.68 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2545  acetyl-CoA acetyltransferase  42.69 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0142026  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1054  acetyl-CoA acetyltransferase  43.47 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312348  hitchhiker  0.00410165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>